O programa funciona em regime semestral com duas admissões por ano. As inscrições para o processo seletivo dos cursos de Mestrado e Doutorado em Ciências Mecânicas da UnB encerram-se nos meses de junho e janeiro de cada ano. A seleção dos candidatos se processa em meados dos meses de julho e janeiro, com as atividades acadêmicas se iniciando em março e agosto, de acordo com o calendário acadêmico da UnB.
O processo adotado para seleção e classificação dos candidatos é realizado pela Comissão de Seleção da Pós-Graduação, com base na análise do curriculum vitae, histórico escolar, Carta de Recomendação, comprovante de proficiência de leitura técnica em língua inglesa. Os candidatos selecionados são comunicados e convocados para efetuar matrícula.
Podem ser aceitos para o curso de Mestrado em Ciências Mecânicas candidatos portadores de diploma de graduação em Engenharia Mecânica ou áreas afins, além de portadores de Licenciatura ou Bacharelado em Ciências Exatas: Matemática, Física e Química. Para o Doutorado, o candidato deverá possuir o título de Mestre em Engenharia Mecânica ou em áreas afins. De acordo com a regulamentação do programa existe a possibilidade de dispensa deste requisito em casos excepcionais.